Hải quan triển khai thu thuế GTGT tự động đối với hàng hóa chuyển phát nhanh

Cục Hải quan thông báo triển khai Thông tư số 29/2025/TT-BTC về việc thu thuế giá trị gia tăng (GTGT) tự động đối với hàng hóa giá trị thấp nhập khẩu qua dịch vụ chuyển phát nhanh. Đây là một bước cải cách quan trọng nhằm đáp ứng yêu cầu thực tiễn trong quản lý thuế.

1. Dừng chính sách miễn thuế GTGT cho hàng hóa dưới 1 triệu đồng

Trước đây, theo Quyết định số 78/2010/QĐ-TTg, hàng hóa nhập khẩu có giá trị dưới 1 triệu đồng qua dịch vụ chuyển phát nhanh được miễn cả thuế nhập khẩu và GTGT. Tuy nhiên, chính sách này đã được điều chỉnh nhằm đảm bảo công bằng thuế và tránh thất thu ngân sách. Cụ thể:

Từ ngày 18/2/2025, theo Quyết định 01/2025/QĐ-TTg, hàng hóa dưới 1 triệu đồng vẫn được miễn thuế nhập khẩu nhưng phải nộp thuế GTGT. 

Tuy nhiên, trong giai đoạn đầu triển khai, hệ thống hải quan chưa được cập nhật kịp thời, dẫn đến việc khai và thu thuế GTGT cho các lô hàng này phải thực hiện thủ công, gây tốn thời gian, dễ sai sót và gia tăng áp lực lên cả doanh nghiệp lẫn cơ quan hải quan.

Nhằm khắc phục tình trạng trên, Bộ Tài chính đã ban hành Thông tư 29/2025/TT-BTC, tạo cơ sở pháp lý và kỹ thuật cho việc tự động tính và thu thuế GTGT đối với hàng hóa giá trị thấp qua dịch vụ chuyển phát nhanh.

Lộ trình triển khai gồm 2 giai đoạn:

• Giai đoạn 1: Thí điểm từ ngày 9-31/7/2025: Áp dụng với một số doanh nghiệp.
• Giai đoạn 2: Từ 1/8/2025: Chính thức áp dụng cho tất cả doanh nghiệp chuyển phát nhanh qua mọi hình thức vận chuyển: đường hàng không, đường bộ, đường sắt.

2. Sửa đổi hồ sơ hải quan đối với hàng hóa chuyển phát nhanh

Cùng với việc triển khai thu thuế GTGT tự động, quy định về hồ sơ hải quan đối với hàng hóa chuyển phát nhanh cũng được sửa đổi. Theo quy định tại Điều 8, Thông tư 191/2015/TT-BTC, được sửa đổi bởi Thông tư 56/2019/TT-BTC và Thông tư 29/2025/TT-BTC, hồ sơ được phân theo 3 nhóm hàng hóa như sau:

Nhóm 1: Tờ khai tài liệu, chứng từ không có giá trị thương mại:

• Khai theo Tờ khai tài liệu, chứng từ không có giá trị thương mại với các chỉ tiêu quy định tại phần A, mục I, Phụ lục II, Danh mục 2 ban hành kèm Thông tư này.
• Nếu khai giấy: sử dụng Mẫu số HQ 01-TKTLCT (Phụ lục I) ban hành kèm Thông tư này. 

Nhóm 2: Hàng hóa xuất nhập khẩu trị giá thấp:

› Khai theo Tờ khai hàng hóa trị giá thấp (nhập khẩu hoặc xuất khẩu), theo chỉ tiêu tại mục II, Phụ lục II, Danh mục 2 ban hành kèm Thông tư này.

› Nếu khai giấy theo quy định tại Khoản 12, Điều 1, Nghị định 59/2018/NĐ-CP:

• Nộp 02 bản chính tờ khai Mẫu số HQ/2015/XK hoặc Mẫu số HQ/2015/NK (Phụ lục IV, Thông tư 38/2015/TT-BTC), theo hướng dẫn mục III, Phụ lục II, Danh mục 2 ban hành kèm Thông tư này. 
• Vận tải đơn hoặc chứng từ vận chuyển tương đương: 01 bản chụp
• Hóa đơn thương mại (nếu có): 01 bản chụp

Nhóm 3: Áp dụng theo quy định tại Khoản 5, Điều 1, Thông tư 39/2018/TT-BTC.

3. Tác động tích cực của chính sách thu thuế VAT tự động

Việc triển khai thu thuế GTGT tự động cùng với sửa đổi hồ sơ hải quan mang lại nhiều lợi ích thiết thực cho cả cơ quan quản lý và doanh nghiệp.

› Về phía cơ quan hải quan:

• Nâng cao hiệu quả quản lý thuế, hạn chế gian lận và thất thu.
• Giảm áp lực xử lý thủ công, nhất là với lượng lớn hàng giá trị thấp.
• Chuẩn hóa quy trình nghiệp vụ, tăng tính minh bạch và thống nhất.

› Về phía doanh nghiệp:

• Giúp rút ngắn thời gian thông quan nhờ khai báo và nộp thuế tự động.
• Giảm sai sót, tránh bị xử phạt do kê khai không chính xác.
• Tạo môi trường kinh doanh minh bạch, công bằng.

Việc triển khai thu thuế GTGT tự động là bước tiến quan trọng trong cải cách thủ tục, hiện đại hóa hải quan và đảm bảo công bằng trong thực thi chính sách thuế. Doanh nghiệp cần chủ động nắm bắt quy định mới để thực hiện khai báo chính xác, đúng quy trình.

Là công cụ khai báo hải quan điện tử được sử dụng rộng rãi hiện nay, Phần mềm ECUS tiếp tục đồng hành cùng doanh nghiệp trong việc tuân thủ đầy đủ các quy định của cơ quan hải quan.

Nguyệt Nga